如何选择内参蛋白?
Western Blot实验中经常提到的一个名称――内参。内参即内部参照,一般是指由管家基因编码表达的蛋白,它们在各组织和细胞中的表达相对恒定,在检测蛋白的表达水平变化时常用它来做参照物。
内参的作用很多,其可以确保所有样本的上样量一致,可以作为校正蛋白样品定量以及上样过程中的误差,保证实验结果的准确性,也可以作为空白对照,检测WB过程中蛋白转膜是否完全以及发光显色体系是否正常。
那么在内参的选择上面我们应该注意什么呢?
根据不同的种属,
比如哺乳动物通常选择β-actin、β-tubulin、GAPDH;植物来源实验样本,则可以选择Plant actin、Rubisco等。
根据蛋白大小选择,
一般要选择目的蛋白与内参分子量相差至少5kD以上,才便于对结果分析。且当研究的蛋白的分子量与内参接近时,需要选择分子量与目的蛋白的分子量差距比较大的蛋白。常用内参蛋白的分子量大小见表1。
表1. 不同来源的蛋白对应的常用的内参蛋白
样本类型
常用的内参蛋白
分子量大小(kDa)
全细胞蛋白
β-actin
43
β-tubulin
55
Cyclophilin A
55
GAPDH
37
α-actin
43
α-tubulin
55
Cyclophilin A
18
Vinculin
116....
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